確診椎體結核主要通過影像學檢查、病理檢查以及實驗室檢查。

1.影像學檢查X線平片表現以骨質破壞和椎間隙狹窄為主，CT檢查可以清晰地顯示病灶部位，骨質破壞的程度，有無空洞和死骨形成。核磁檢查在結核炎性浸潤階段即可顯示異常信號，能清楚顯示脊柱結核椎體骨炎，椎間盤破壞，椎旁膿腫及脊髓神經有無受壓和變性。

2.病理學檢查病變部位穿刺活檢以及手術后病理組織學和微生物學檢查是確診的重要方法。病理學檢查可見典型結核性肉芽腫，且通過抗酸染色或其他細菌學檢查證據證明為結核桿菌感染是確診的依據。

3.實驗室檢查包括血液學、免疫學、細菌學、分子生物學檢查等。