深蹲會造成膝關節、髖關節的損傷，膝關節的損傷，如長期深蹲，會加重膝關節的損傷，導致膝關節的軟骨反復受到沖擊和摩擦，軟骨受到的壓力增大，容易導致軟骨出現損傷，甚至發生軟骨的剝脫。

深蹲不僅損傷軟骨，還會損傷膝關節的半月板，導致半月板出現磨損，出現膝關節退行性改變，晚期會形成骨性關節炎等。

同時深蹲也會造成髖關節損傷，導致雙側的股骨頭壓力增大，骨股頭為了適應長期的負重會反應性增生，形成髖關節炎。

因此深蹲對髖膝關節的危害相當大，深蹲的時候，應當注意的正確的姿勢，盡量減少髖膝關節的損傷，同時防止腰肌扭傷。