腸系膜上動脈栓塞主要與腸系膜上動脈粥樣硬化、心臟栓子脫落、惡性腫瘤等因素有關。

1、腸系膜上動脈粥樣硬化

腸系膜上動脈粥樣硬化是動脈壁內壁有脂質積聚、纖維組織增生和鈣質沉著。動脈粥樣硬化斑塊可堵塞腸系膜上動脈，造成腸系膜上動脈栓塞。

2、心臟栓子脫落

臟疾病如心房顫動、心內膜炎等，可能導致心臟內血栓形成，血栓脫落后隨血液流動進入腸系膜上動脈，引起腸系膜上動脈栓塞。

3、惡性腫瘤

惡性腫瘤可導致血液處于高凝狀態，使得腸系膜上動脈內出現血栓，血栓脫落后可引起腸系膜上動脈栓塞。