髓母細胞瘤形成的確切原因尚不完全清楚，但研究表明可能與遺傳因素、胚胎發育異常、染色體異常等因素有關。

1.遺傳因素

某些遺傳突變被認為與髓母細胞瘤的發生有關。家族性遺傳疾病如Li-Fraumeni綜合征和家族性中樞神經系統瘤病（Neurofibromatosis）與髓母細胞瘤有關聯。

2.胚胎發育異常

在正常情況下，髓母細胞應該在胚胎發育過程中分化成不同類型的細胞，但當這個過程出現異常時，髓母細胞可能會發展成為腫瘤。

3.染色體異常

研究表明，染色體的異常變化可能與髓母細胞瘤的發生有關。比如部分患者的腫瘤細胞中發現有N-MYC基因擴增，這與腫瘤的惡性程度相關。