切除膽結石其實一般不會造成太大危害，過度宣揚膽囊的功能，以及盲目地保膽才是更大的危害。膽囊切除是治療各種膽囊良性疾病的首選方法，特別是對于有癥狀的膽囊結石、有癌變風險的某些膽囊良性占位，以及長期膽囊慢性炎癥者，都建議去做膽囊切除。

膽囊雖然是人體儲存和濃縮膽汁的器官，但膽囊切除并不影響膽汁的正常分泌，膽囊切除后一段時間身體也會逐漸代償。膽囊切除后早期容易出現消化不良、腹脹、腹瀉等癥狀，可通過飲食控制和對癥藥物治療，多數可緩解。

此外，膽囊切除并不增加膽管結石、結腸癌的發病率。