肛門特別疼可能是由于肛裂引起，比如患者肛管狹窄，在排便時糞便干結(jié)，可導(dǎo)致肛管皮膚被撕裂，從而出現(xiàn)疼痛癥狀。同時可伴有瘙癢、便血等癥狀。

其次，如果患者因不良的排便習(xí)慣或者不良的飲食習(xí)慣等因素，誘發(fā)了內(nèi)痔，當(dāng)痔核脫出肛門外沒有及時回縮被卡住時，可導(dǎo)致痔血液供應(yīng)中斷，引起組織壞死或者感染，可出現(xiàn)劇烈疼痛癥狀。

此外，肛周膿腫、肛瘺等疾病，也可能會導(dǎo)致肛門特別疼。