肛瘺是一種常見的肛腸疾病，多發病于青壯年男性，但其他年齡及女性也可發病。肛瘺是由于肛腸部位受到感染，由肛竇炎等炎癥引起，由內而外發病。在發病初期，肛周部位可見膿包，叫做肛周膿腫，肛周膿腫破潰后，皮下組織形成纖維化的瘺管，就是肛瘺。
肛瘺不能自愈，手術后容易復發，究其原因可能有以下方面：
1、腸腔中的糞便、腸液和氣體繼續進入瘺管，刺激管壁，使管壁結締組織增生變厚，管腔難以閉合;
2、內口的存在，膿腫雖然破潰或已切開引流，但原發感染源如肛竇炎或肛腺感染依然存在，腸腔內容物還可從內口繼續進入瘺管;
3、管道多在不同高度穿過肛門括約肌，括約肌收縮阻礙膿液排出，以致引流不暢。
4、肛門部不能靜養，膿腔不易粘合，排糞、排尿時，因括約肌收縮或因炎癥刺激肛門括約肌，使肛門括約肌經常處于痙攣狀態;
5、膿腔引流不暢，或外口縮小，時閉時潰，膿液蓄積腔內，導致膿腫再發并穿破而形成新的支管或瘺道;除此之外，結核克隆重氏病、潰瘍性結腸炎等都是形成肛瘺的原因。