胸外科可以檢查食道、肺部、乳腺、縱膈等部位，其可以用于檢查和治療肺囊腫、慢性阻塞性肺疾病、肺不張、肺部血管瘤、肺平滑肌瘤、肺炎、肺結核、肺膿腫等肺部疾病，也可以用于檢查和治療胸腔疾病，比如氣胸、膿胸、胸膜炎、胸膜結核、胸腔積液、縱膈腫瘤等。還可以用于檢查和治療食道炎、食道癌、賁門失弛緩癥、胃食管反流等，胸外科還可以檢查和治療肋間神經痛、肋軟骨炎、雞胸、手汗癥、乳糜胸、膈疝等疾病。