腸內瘺患者常見癥狀有腹瀉、體重減輕、營養不良等。若是腸外瘺，患者患者可在體表出現瘺口，通常會有食物或氣體從瘺口流出，并伴有劇烈腹痛、瘺口紅腫、發炎、腹脹、發熱等表現。由于瘺口造成腸液流失，部分患者還會有電解質紊亂、酸堿失衡等癥狀，例如低鉀、代謝性酸中毒、堿中毒等。另外，腸瘺引起腹腔感染，影響進食患者還會出現營養不良的問題。若瘺口治療不及時繼發膿毒性休克，可危及患者生命。