用母血檢查染色體主要是用來鑒別胎兒的性別。如果出現用母血驗不出y染色體的現象，應該是懷孕時間較短的原因。或者是抽取的血液比較少，而血液中可供提取的DNA含量不足的原因。

用母血檢查染色體目前常用于判斷胎兒的性別。一般是早孕期做超聲，胎兒符合至少7周以上才可以抽取母血檢查染色體。驗不出y染色體有兩種可能情況。一種可能性是孕周太小，或者是抽取的血量不足，導致血液中可供提取的DNA含量不夠，從而無法準確檢出。另一種可能性是母血中確實不含有y染色體，也就是說胎兒的性別是女性。目前我國是禁止非醫療性檢測胎兒性別的。