首先，細菌性拉肚子患者多拉粘液血便或膿血便，而病毒性拉肚子患者則多拉稀便；其次，細菌性腹瀉一般有較大異味，而病毒性腹瀉則沒有；此外，建議患者做糞便常規檢查，出現紅細胞的則為細菌性腹瀉，沒有紅細胞的則為病毒性腹瀉。

病毒性腹瀉和細菌性腹瀉的區別，正常情況下肉眼一般是沒有辦法區分是病毒感染還是細菌性感染引起的腹瀉。往往根據經驗，有些腹瀉比較頻繁，還會稀便，這個時候病毒感染的可能性比較大，如果腹瀉伴有一些粘液，膿液或腹痛，這個時候可能是細菌感染引起的腹瀉。是細菌還是病毒，最好去正規醫院做糞便常規檢查，看看大便中是否有紅細胞，以及病毒或細菌。