腰椎間盤突出微創手術部分患者會在手術過程中出現硬膜囊、脊髓、神經損傷，術后會有局部出血、傷口感染的風險。但任何手術都具有風險性，患者應選擇正規醫院，術后多休息，避免重力勞作。

腰椎間盤突出癥的風險是在數字減影血管造影透視下使用前后聯合透視。同時，注射臭氧氣體用于椎旁釋放不會以小的風險損傷椎旁神經根。然而，有些人在接受三氧消融后對頸、腰椎間盤的調節不完全。再次從事重體力勞動可能導致頸、腰椎間盤再次突出，因此術后3-6個月可以避免重體力勞動。