5-氟尿嘧啶軟膏的主要功效與作用是抑制腫瘤代謝以及治療傳染性軟疣。一般腫瘤疾病包括消化道腫瘤，絨毛膜上皮癌。而傳染性軟疣則多見于尖銳濕疣，主要與hpv病毒感染有關。

5-氟尿嘧啶軟膏屬于一種抗代謝抗腫瘤的藥物，對增殖性細胞都具有很好的抑制和殺傷性作用。5-氟尿嘧啶軟膏在體內轉化為相應的核苷酸而發揮其抑制腫瘤的作用。還能夠有效地抑制胸苷酸的合成，起到抗腫瘤的功效。治療尖銳濕疣，主要適用于惡性葡萄胎，消化道腫瘤，絨毛膜上皮癌，也可用于多種疾病的輔助治療，如皮膚癌，角化過度，疣狀損害，外陰白斑，乳腺癌的胸壁轉移等。