腸鏡可分為無痛腸鏡和有痛腸鏡。無痛腸鏡會通過藥物抑制人體中樞反應，降低患者注意力，可以幫助降低應激反應。有痛腸鏡患者可以感知到醫生的操作，存在一定痛苦。

腸鏡有有痛和無痛之分，有痛的腸鏡是有痛苦的，但是無痛腸鏡是通過藥物作用引起人體中樞抑制，使患者處于安靜，不焦慮，注意力降低的環境中。在這個環境，患者會產生遺忘和行動遲緩。因此，患者的耐受力可以大大的提高，應急應激反應可以大大的降低，以便減輕病人的恐懼感以及不適的感覺。但是要注意無痛腸鏡后的副作用。